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教廷，教宗一人独自在教堂中祈祷:上帝，愿你指引我们前进的方向。而在教宗沉思之际，让他非常意外的是，有一只手附上了他的肩头，教宗感到疑惑不已，在这个时间点，枢机主教们不可能前来见他，更不可能作出这样的举动，究竟是谁呢？教宗正要转过身去看个究竟，突然身后响起了耶和华的声音：需要指引方向的，恐怕不仅仅是你一个人吧？教宗听着这个熟悉的声音，猛然惊醒道：为何您亲自降临了？吾主？耶和华哈哈大笑道：我又不是第一次来到人世，何必如此惊讶呢？不过你也应该明白，我没有重要的事情，是不会轻易来到人世的。
教宗点了点头，回答：那吾主有什么问题吗？这个问题还需要你大力相助啊？教宗的肩膀再次附上了一只手，让教宗更加疑惑，谁能和上帝一同现身呢？难道是圣子吗？教宗身后之人似乎猜到了教宗的想法，答道：我可不是耶稣啊，至于我是谁，你也不会陌生，转过身来吧。教宗闻言转过身去，看到了路西法的身影。教宗此刻的心情无法用语言来形容，他木讷的看着耶和华，问道：吾主，这是怎么回事？为什么撒旦会与您一同出现？耶和华尴尬地打了个哈哈，回答道：多亏了吾主，天使一族重归一统了，如今已经没有什么天使与恶魔的区别了，所有天使都已经算是天使。
教宗听完耶和华的话，更加疑惑，问道：吾主的吾主？您之上还有存在吗？耶和华点点头，说：是啊，今后不要再称呼我为上帝了，我们天使一族有了新的上帝，作为我们的信徒，你也要作出改变。教宗虽然还没彻底搞清楚究竟是怎么回事，但他大致明白了耶和华的意思，答道：这恐怕不好，我们尊奉您为神灵已经有几千年的历史了，怎么能更改呢？耶和华笑道：并非更改，而是将上帝的身份转让，从此上帝不是耶和华，但是你们尊奉的仍然是上帝。说到底只是上帝的神名改变了，没有其他变化，你安心就好。
教宗点点头，又问道：您此次前来，不会只是为了这点小事吧？耶和华点点头，答道：根据天使议会第五十三号决议案，我们决定对潜藏在人类中的异端进行清洗。所以必须获得你的帮助，因此我和路西法才来到这里。教宗疑惑道：天使议会？五十三号决议案？您在说些什么？教宗会感到疑惑，也在意料之中，事情还要追溯到徐子毅向天使议会下达命令之后。天使议会就此事展开了讨论，最后决定，以希尔吉留守天使议会，主持日常事务，清洗任务由耶和华和路西法负责执行，以加百列为首的六位大天使，负责情报收集工作，以米迦勒为首的六位大天使，负责征集军队工作，以阿撒泻勒为首的六位大天使，负责反情报与潜入工作。
在天使议会作出决议之后，耶和华和路西法离开了天使议会，来到了教廷，以教廷为人间的中心，开始执行议会的决议。虽然教宗仍然不能理解这件事情，唯我独尊的上帝为何会突然服从所谓的天使议会？但既然是吾主下达的命令，也就只能遵守了。于是教宗不再提出问题，而是点头表示支持耶和华的决议。耶和华在征求教宗同意后，开口道：既然如此，那我们必须成立相应的人类组织来配合天使执行这件事，路西法，你有什么主意？路西法回答：我认为主要任务还是要交给人类，天使不应该卷入太深，因此我们应该成立相应的机构来执行这件事。
耶和华点点头，说：既然如此，那我们就成立一个神恩净化部好了，名副其实，用神恩来净化那些人类中的异端。路西法听完点点头表示赞同，但是他随后开口说：仅仅是净化远远不够，我们还需要成立神罚执行部，让他们明白不服从神恩会是什么下场。教宗听了路西法的话，不寒而栗道：这似乎没有必要吧？如果能够做到不流血的净化，为什么要流血呢？耶和华却赞同路西法的提议，对教宗说：有时候只展示仁慈是远远不够的，还需要展示力量。路西法的话很对，我们一味仁慈，会被认为是软弱，这样更助长了异端的气焰。
教宗听到耶和华这样说，勉强同意了耶和华的观点，但内心仍然有些担心，路西法这样的恶魔如果掌握了生杀大权，会怎么做事，真的不能让人安心。但实际上，人命对于路西法来说，虽然无足轻重，但正因为无足轻重，路西法也就没有杀戮的欲望。对他来说活人和死人都是一样的，杀没有益处，不杀也没有益处，那就随他去吧。主意打定，耶和华着手组建神恩净化部，路西法着手组建神罚执行部。神恩净化部以白衣为制服，神罚执行部则以黑衣为制服。在接下来的行动中，两个部门将发挥举足轻重的作用，对于徐子毅统一地球也好，对于黑衣议会针对奥坦与卡伊也好。
凡是重大的行动，如今已无法避开这两个部门的干预了，毕竟以人类为基础的话，那人类的势力会渗入各个层面也不足为奇了。但说起来想要组建两个部门，也绝非易事。虽然有教廷的枢机主教们作为骨干，但毕竟需要大量的人手，而关于征募信徒还是征募普通人，耶和华与路西法也产生了分歧，对于忠诚问题二人的看法完全不同。耶和华认为如果只征募信徒的话，可以保证成员的忠诚。
而路西法则认为，人类这种生物毫无忠诚可言，只会服从于力量，背叛是他们的生存之道。因此征募信徒与征募普通人，并不会有什么区别。暂且不论两者的观点哪一方是正确的，就眼下而言，路西法的提议的确是更加现实，因为想要征募如此大量的信徒，是不切实际的事情。耶和华明白这一点，因此他也被迫同意了路西法的提议，不过这种做法也有副作用，这副作用，最后会导致意想不到的事情发生，这却是耶和华和路西法都难以预料的事情。