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如此持续了三日，方才散尽异象，却有九黎族族长之妻诞下一麟儿，哭声震天，直将天上的浮云震散。那婴儿小小年纪便长得浓眉大眼，叫声响亮，手腿壮硕且头上长角。族长大喜不已，认为是天将神子于他，并为他取名为：蚩尤，将希望都寄托在蚩尤身上。
蚩尤乃是天生神力，少年时就以力大闻名于族中，东夷人好战，故而九黎族也不例外。每次在族中的比武中蚩尤都大获全胜，且其为人豪爽异常，那些战士因其武勇，故而对他言听计从，小小年纪的他，就在族中的威望甚高，族长看后心中兴奋不已，暗叹九黎族终于有了传人！
蚩尤出生时就有大神通，能操纵天地间的元素力量，更为让族人敬重的是他肉体极具强悍，莫说寻常的刀刃，即便是神兵利器也无法在他身上留下一丝一毫的痕迹。族人都说蚩尤为天人也！可是蚩尤自己明白，自己身上有着巫族的血脉，他是巫族与人族通婚后出生的。虽然巫族早就已经战败，但蚩尤却对巫族当年的辉煌念念不忘。总是是想着怎么样才能让巫族再次统一大地。终于蚩尤在庐山脚下发现了铜矿，他们把这些铜制成了剑、矛、戟、盾等兵器，军威大振，再加上巫族天生不会臣服的性格，便起野心要夺取人皇之位。
蚩尤首创法规，实施刑事法，以肃纲纪，士卒的战斗力却来越高，蚩尤等士卒都练成之后便开始用兵，将周围的几个部落给灭掉了，一时九黎部落周围的部落大为恐惧，这些部落要么搬迁道北方去了，要么融入了九黎部落，最终有八十一个部落加入九黎部落，蚩尤将众巫人全部散到八十一个部落之中，让他们去管理这八十一个部落，经过数十年的发展，九黎部落中有巫族血脉的人越来越多，九黎部落也越来越强。蚩尤联合了风伯、雨师和夸父部族的人，一起伺机而动。
就在此时神农终于将丹药之术研习完毕，给族民留下了炼制药丸的方法和一些药方，而他的《神农本草经》也终于完成了。于是神农得到太上老君的符诏，说他功德已满，让他将人皇之位传于他人，自己随伏羲去火云洞清修。
神农在接到符诏之后便着手准备传位所需的一些事物，最终神农还是将人皇之位传于公孙轩辕，在传位的这天，太上老君和伏羲两位圣人都前来观礼，只见在神农将人皇之位传于轩辕之时，天降功德笼罩在神农身上，霞光散去，神农也依然证了地皇之位。伏羲上前稽首道：“恭喜师弟证得地皇之位。”说完便让童儿牵来龙马与神农同乘，在万民的恭送下向三十三天外火云洞飞去。一点也不担心自己小师弟的安危~！可见人品多么恶略。
自从神农将人皇之位传给轩辕去火云洞清修，轩辕便成为天下共主，因轩辕有土德故号黄帝。黄帝轩辕接任后便在人族中推广自己在有熊部落所发现的新的耕种之法，与民休养生息。可是蚩尤对于黄帝接任人皇之位并不服气，他认为自己九黎部落的实力超越了有熊部落，黄帝不该成为人皇，于是仗着自己部落有一众巫族助阵，而且部落的士卒战力也超过黄帝便开始不断的骚扰黄帝，气势汹汹地来向黄帝挑战。黄帝生性爱民，不想战伐，一直想劝蚩尤休战。
黄帝生性爱民，不想战伐，一直想劝蚩尤休战。可是蚩尤不听劝告，屡犯边界。黄帝不得已，叹息道：“我若失去了天下，蚩尤掌管了天下，我的臣民就要受苦了。我若姑息蚩尤，那就是养虎为患了。现在他不行仁义，一味侵犯，我只有惩罚不义！”于是黄帝亲自带兵出征，与蚩尤对阵。
黄帝先派大将应龙出战。应龙能飞，能从口中喷水，它一上阵，就飞上天空，居高临下地向蚩尤阵中喷水。刹那间，大水汹涌，波涛直向蚩尤冲去。蚩尤忙命风伯雨师上阵。风伯和雨师，一个刮起满天狂风，一个把应龙喷的水收集起来，反过来两人又施出神威，刮风下雨，把狂风暴雨向黄帝阵中打去。应龙只会喷水，不会收水，结果不但没有对蚩尤造成什么损失，还将自己的兵将虐待了一通。
无法，轩辕只好寄希望于自己的士兵，妄图凭借士兵的战斗力与蚩尤决一胜负。可是九黎部落里面有巫族族人，部落勇士的战斗力也当然超过黄帝，并且九黎部落已经开始使用铜做的兵器，而黄帝的士卒却还在使用石头和动物的骨头做的兵器，在装备上也根本不是蚩尤九黎部落战士的对手，一接战黄帝就是大败而归。
这样，黄帝和蚩尤打了整整十五年，打了七十一仗，结果是黄帝胜少败多，黄帝心中非常焦虑不安，日夜盼望能有贤哲辅佐他，以灭蚩尤。扬尘在凌仙岛是实在看不下去了，自己的徒弟被打得这么凄惨，他这个当师傅的怎么可以忍？当天晚上，扬尘就托梦给轩辕，让轩辕梦见大风吹走了天下的尘垢。接着又梦见一个人手执千钧之弩驱羊数万群。
轩辕醒来后，心中虽然觉奇怪，但身为人皇的悟性，轩辕是非常合格的。轩辕暗想“风，号令而为主；垢，是土解化清，天下难道有姓风名后的人吗?千钧之弩，是希望为能致远，驱羊数万群，是牧人为善，难道有姓力名牧的人不成?”于是当下便派出部下，在天下到处访寻这两个人。结果在海隅找到了风后，在泽边找到了力牧。黄帝找到二人之后便以风后为相，力牧为将，开始大力整顿部落，为了彻底打败蚩尤，黄帝特意召来女儿女魃助战。女魃是个旱神，专会收云息雨。平时住在遥远的昆仑山上。希望能够战胜蚩尤还天下百姓一个安宁。
而蚩尤也却是一天才，他利用这十五年时间将部落中的八十一名后天巫人炼成了自己的分身，而且采集北海海底万年寒铁，然后用首山赤铜，大巫精血才制成了八十一杆大旗，且利用巫族最强的十二都天神煞阵，将八十一个分身组成了一个威力强大的玄阴炼魂大阵，此阵一旦布出就会有都天煞气充斥其中，端的是人进人死，神进身亡。
而且进入此阵之中一旦被杀死，魂魄无法进入六道轮回，会被阵中附在蚩尤旗上的蚩尤分身所食，增强分身的力量，使得玄阴炼魂大阵的威力进一步增强，而且被杀死之人在魂魄被蚩尤分身所食之后会产生大量的怨气，这怨气又会被玄阴炼魂大阵炼成都天煞气，大阵中的都天煞气越多，大阵的威力又会变得越大。而此阵祭炼到最后便会形成都天神煞阵，到那时便可招出十二祖巫真身对敌，甚至若是蚩尤能得到一滴祖巫精血更是有可能炼成盘古真身，到那时就是圣人也轻易杀不死他。直到此时，巫族剩余的一众大巫才佩服起蚩尤来，真正愿意听从蚩尤的号令。
那蚩尤旗却是可以逆天的宝贝，且其为至凶之物。此旗炼成之时天也为之泣，只见整个九黎部落中煞气冲天，在天上形成一片煞云，天降雷劫劈之，意图将这大凶之物毁去，却被刑天等大巫所挡，于是天降血雨，直下了七天七夜，一时间整个洪荒中的练气士都被惊动了，一个个都紧闭洞门怕这煞气沾上自己，毁去自己无数年的修炼。扬尘也被这无边的血雨所惊动，忙仔细推算，却推算出是蚩尤搞出来的动静，也就不怎么担心了。蚩尤自炼出蚩尤旗后便大肆进攻黄帝，吸收了无数的灵魂和煞气，将蚩尤旗祭炼的越发厉害。
黄帝自先得常先、大鸿后又得风后、力牧，又有大神应龙相助，且蚩尤自炼成蚩尤旗后便大肆进攻黄帝，使得黄帝族民死伤无数。黄帝便欲再次征伐蚩尤，众臣亦愿随黄帝再次征讨蚩尤以使天下太平。黄帝遂起大军向蚩尤九黎城行去，蚩尤闻黄帝再次亲帅大军前来攻伐，谓左右道：“轩辕小儿不自量力，上次败回，今我炼成大阵，其竟又来。实不畏死也，其心可嘉。其若做家中不出，我还需费些功夫将其击败，今其率大军而来我当将其斩杀于此，夺得人皇之位。”说完便率军而出，意欲一战而定，将黄帝斩杀于此。
黄帝布好阵容，再次跟蚩尤决战。两军对阵，黄帝下令擂起战鼓，那八十面牛皮鼓和夔牛皮鼓一响，声音震天动地。黄帝的兵听到鼓声勇气倍增；蚩尤的兵听见鼓声丧魂失魄。蚩尤看见自己族人的形势不妙，便将九九八十一面蚩尤旗祭出，布出玄阴炼魂大阵将众人困于其中，众人只觉突然间天昏地暗，日月无光，阵阵煞气滚滚如黑云一般向众人卷去。好在蚩尤重在逃跑，没有使出真正的威力。黄帝见状欲退兵改日再战，却不想黑雾都将天挡住乐，众人皆是不辨东西，却是无法退出。众人一时极为惊慌。黄帝也是一阵无奈。（未完待续）