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第二天，林清华就率领着五百精兵护送太子坐船南下，这五百精兵是太子亲自从高杰军中跳选的，林清华的部队则由陈唯一率领，穿明军服装从路陆南下。和林清华与太子一起的除了萍儿、圆圆之外，还有四名文官和高杰的一员副将。
十日之后，林清华与陈唯一会合于长江北岸的瓜洲，林清华令陈唯一率部留守此地，自己则率五百精兵便装护送太子进入南京。
一进南京，随行文官便将太子领进了潞王府。这潞王本来也有可能登基称帝的，他在大臣们中的名声远比福王好，朝中文臣多支持他登基，但由于他只是皇帝的侄子，而福王是万历皇帝的嫡孙，又有手握重兵的马士英支持，因此他便在皇位的竞争中败下阵来，心中甚是不服，如今太子已到，虽然自己更没希望称帝，但若支持太子登基，扳倒福王，则自己必然大富大贵，前途不可限量，因此十分高兴的在府内秘密接纳了太子。林清华率一百精兵入府保护太子，其它四百精兵则在附近的旅店住下随时听命。
接下来的两天，潞王府内的文臣武将、大小官员四处串联，不断得将忠于太子和潞王的大臣拉拢过来。到了第三天的晚上，一场策划政变的秘密会议便在潞王府召开了。
在大门紧闭的潞王府议事厅里，气氛紧张而凝重，几十名身着便服的文臣武将正向坐在太师椅上的朱慈琅表示忠心。
“臣姜曰广誓死效忠太子。”
“臣黄道周能活着见到太子，实在是托了先皇的福，臣肝脑涂地以报太子。”
“臣侯方域愿为太子前驱，扫平逆贼，平定天下。”
“臣”
站在太子身边的林清华望着这些人，耳中听着这些如雷灌耳的名字，心潮澎湃，久久不能平息。这些人可都是历史上的鼎鼎大名的人物啊，他们大多是东林党和复社的代表人物，都是忠于明朝的人，有的人在明亡以后自杀殉国，有的则至死都不肯致仕。
太子待众臣说完，朗声说道：“众位爱卿忠心可鉴，事成之后定有重赏，还望诸位今后戮力以扑，齐心协力，与孤王一道中兴大明社稷。林参将，你将明天的行事计划说给大家听听。”
林清华忙说：“臣遵旨。”说完便从怀里掏出一封信来。
“这是今天中午湖广总兵左良玉左大人差人送来的奏章。左大人在奏章中历数马士英祸国殃民的罪状，同时对伪福王篡位谋逆痛加批驳。奏章的详细内容我就不念了，明日早朝时就劳烦右都御史张慎言张大人在朝堂之上大声念出来，诸位便可乘机群起攻之。待时机成熟时，派一人到宫门旁吹响此铜哨，听到哨响，我便率领五百死士冲入宫内，将那逆贼一举拿下，则大事可成。”
张慎言接过奏章和铜哨，领头跪下说道：“臣定不负太子重托，太子只管坐镇王府，静候臣等佳音。”
太子说道：“众位爱卿快快平身。前几日，江北四镇也给孤王送来效忠书，表示与孤王齐心协力铲除国贼，有如此忠心的大臣，何愁大事不成？诸位快回去准备吧。”
待众人走后，太子对着林清华说道：“林爱卿，你认为此事可成吗？”
林清华道：“太子放心，臣拿脑袋担保，此事一定成功。”其实能否成功，林清华心中也没底，不过他也做好了一但失败便逃之夭夭的准备。还在瓜洲时，林清华便吩咐陈唯一准备船支与粮草，随时准备开溜。
七月的南京已经入夏，虽然才是初夏，但已是酷热难当。“南京真不愧是中国的火炉啊，才七月就这么热。”林清华想道。此时的他正坐在离皇宫不远的一个茶馆中，一边扇着扇子，一边喝着凉茶。从早朝开始，他和部下已等了两个时辰了，先后派了几个人去皇宫附近打探，但皇宫里一点动静也没有。“莫非宫中有变？有人告密？”想到这里，林清华心中愈发焦虑起来，手中的扇子摇的也更快了。
突然，一阵急促的脚步声将林清华的思绪打断，一个派去打探的人跑进了茶馆，向着林清华气喘嘘嘘的说：“快快哨子响了，在东门。”
林清华霍的一声站起，掏出手枪，冲出茶馆，到了街上大呼一声：“行动！”
那些化装成乞丐、行人、樵夫的部下听到号令，纷纷从腰间和柴垛里抽出长短兵器，跟着林清华向皇宫东门冲去。一时之间街上鸡飞狗跳，行人纷纷躲避，街上的店铺也纷纷关门歇业。
林清华率众冲到东门，只见东门仍然紧闭，他便吩咐部下将背在身后的八个火药桶堆在门外，点燃之后隐蔽在墙边。“轰”的一声巨响，木门应声而碎。木门的碎片还未完全落地，林清华便率众冲进了皇宫。
待众人冲到武英殿前，只见殿前数百衣甲鲜明的禁卫军正在列队，本来他们是奉诏入殿镇压的，不料先是被一声爆炸声吓了一跳，接着就看见一群“暴民”挥舞兵器冲进宫来，当下不等列队完毕便迎了上去。
林清华手一挥，喝道：“杀！”话音未落，众人便如饿虎扑食一样扑向禁卫军。那群禁卫军平时养尊处优、锦衣玉食，哪里是久经沙场的士兵对手，片刻之间便被杀得落荒而逃。
林清华制止了部下的追杀，带领众人杀进武英殿。
武英殿中早已乱成一团。群臣本来在天刚蒙蒙亮时就已入朝，但皇帝因昨晚酒色过度，一直到日上三杆才起床。早朝一开始，张慎言就将左良玉的弹劾奏章当着众人的面念了出来，念到马士英祸国殃民时，那马士英的脸色就变得极为难看，念到福王是假冒的时，马士英再也忍不住了，口中不停的念道：“狂悖至极！狂悖至极！”还从张慎言手中夺过奏章撕个粉碎，向皇帝奏道：“臣请讨伐左良玉。”还未等皇帝发话，群臣便对马士英痛加斥责，紧接着更有人对福王的身份提出了质疑，要福王或者拿出证据或者退位。其他蒙在鼓里不知根底的大臣见势不妙，纷纷闭口不言，明哲保身。马士英与皇帝看见这个阵势，心知不妙，赶忙下令禁军进殿弹压。但禁军尚未进殿，众人先是听到一声巨响，跟着传进耳中的是殿外的喊杀声，众人正茫然间，就看见林清华率众冲进了殿。
林清华命令手下看住群臣，不许任何人出入，抬头便看见一个身穿龙袍、缩在龙椅上瑟瑟发抖的人，心想：这便是皇帝吧。于是迅速冲了过去，一把揪住那人衣领，将其掀翻在地上，用手枪顶住他的脑门，恶狠狠的问道：“快说，是谁让你假冒福王篡夺大明江山的？不说实话，我一枪崩了你！”皇帝见人冲进殿时便已吓的半死，待被林清华掀倒后，更是吓得屎尿齐流，虽然来人只是用一个奇怪的东西指着自己的头，但料想也不是什么好东西，整个人完全吓呆了，只是张着嘴：“啊、啊”却半个字也吐不出来。
林清华只好低下头去，小声对他说：“别慌，你只需点头，但不许摇头，否则我宰了你！”这句话皇帝总算听懂了，忙点了点头。
林清华大声问道：“是马士英让你假冒福王的吗？”皇帝忙点点头。
群臣见状，立时群情激愤，先是对马士英破口大骂，接着便把马士英围了起来，你一拳我一脚的打了起来，可怜马士英戎马半生，竟被一群文臣活活打死。
林清华趁此机会令手下将皇帝绑了起来，堵上嘴后押回潞王府严加看管，并派人去接太子入宫。
不到一盏茶的工夫，太子便被潞王亲自护送，用小轿抬入宫中。在清除了马士英的余党并宣布全城戒严后，太子朱慈琅便在众臣的簇拥下，身穿一件从后宫找到的龙袍，于武英殿正式登基称帝，改元中兴，并大赦天下。